清華團(tuán)隊(duì)打造生物研究“透視眼”技術(shù)
原創(chuàng) 清華大學(xué) 清華大學(xué) 北京
在生物研究里,研究人員一般要取下離體組織樣本,經(jīng)過(guò)反復(fù)切片、逐層成像,才能慢慢還原其內(nèi)部結(jié)構(gòu)。然而,一旦切片,就會(huì)破壞整體,導(dǎo)致結(jié)構(gòu)錯(cuò)位、空間斷層、信號(hào)損耗等問(wèn)題,最終只能拼湊出一幅支離破碎的三維圖景。
那么,能否給科研人員裝上“透視眼”,不破壞生物結(jié)構(gòu),也能看清其內(nèi)部奧秘呢?
近日,清華大學(xué)生物醫(yī)學(xué)工程學(xué)院苑克鑫副教授團(tuán)隊(duì)提出了“玻璃態(tài)組織透明化”技術(shù)Vitreous Ionic - liquid - solvent - based Volumetric Inspection of Trans - scale biostructure(簡(jiǎn)稱:VIVIT)。這一創(chuàng)新方案能讓離體生物組織在不被破壞、無(wú)形變的前提下,以原貌的三維結(jié)構(gòu)呈現(xiàn)在鏡頭前。
相關(guān)研究成果于北京時(shí)間8月11日晚,以《VIVIT:通過(guò)離子玻璃態(tài)組織揭示跨尺度生物結(jié)構(gòu)》(VIVIT: Resolving trans - scale volumetric biological architectures via ionic glassy tissue)為題,在線發(fā)表于《細(xì)胞》(Cell)。
Cell網(wǎng)站論文截圖
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首次實(shí)現(xiàn):低溫下將生物組織整體轉(zhuǎn)化為“玻璃態(tài)”
為避免切片帶來(lái)的損傷,組織透明化技術(shù)應(yīng)運(yùn)而生。它能通過(guò)化學(xué)方法讓組織光學(xué)透明,使研究人員可直接觀測(cè)內(nèi)部結(jié)構(gòu),無(wú)需層層切片。但現(xiàn)有的透明化方案存在諸多問(wèn)題,如組織在處理中會(huì)膨脹或收縮,空間結(jié)構(gòu)被扭曲;蛋白熒光信號(hào)易損失,圖片對(duì)比度下降;樣本冷凍保存會(huì)被冰晶損傷,導(dǎo)致結(jié)構(gòu)破壞。
在真正還原三維結(jié)構(gòu)方面,學(xué)界一直缺乏一個(gè)兼顧結(jié)構(gòu)保真、信號(hào)增強(qiáng),且支持樣本長(zhǎng)期保存與無(wú)損復(fù)用的解決方案。而苑克鑫團(tuán)隊(duì)創(chuàng)新的VIVIT技術(shù),正是彌補(bǔ)這一缺口的關(guān)鍵。
與以往僅追求透明度的方法不同,VIVIT從一開(kāi)始就追求更高目標(biāo),即在實(shí)現(xiàn)光學(xué)透明的同時(shí),最大限度保留組織原有的空間結(jié)構(gòu)與分子信息。
VIVIT讓組織實(shí)現(xiàn)透明化
通過(guò)團(tuán)隊(duì)自主研發(fā)的高折射率離子液體,VIVIT首次實(shí)現(xiàn)了在低溫下將生物組織整體轉(zhuǎn)化為“玻璃態(tài)”,使其在光學(xué)上通透,在物理上穩(wěn)定。實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)顯示,經(jīng)過(guò)VIVIT處理后,組織的形變率低于1%。像腦組織這種結(jié)構(gòu)精密、連接復(fù)雜的樣本,也能保持原有形態(tài),包括神經(jīng)突觸在內(nèi)的亞細(xì)胞級(jí)精細(xì)結(jié)構(gòu)同樣能清晰呈現(xiàn)。
VIVIT技術(shù)揭示人類(lèi)大腦皮層的微連接
突破:不止“看得清”,更能“保得住”“用得上”
VIVIT的突破不僅在于能“看得清”,更在于“保得住”和“用得上”。
通過(guò)特殊離子液體對(duì)分子微環(huán)境的優(yōu)化,VIVIT顯著提升了組織內(nèi)熒光信號(hào)的強(qiáng)度。熒光標(biāo)記的組織經(jīng)VIVIT處理后,多種常用染料的熒光信號(hào)可增強(qiáng)至原始的2至30倍,讓以往難以檢測(cè)的微弱標(biāo)記也能清晰呈現(xiàn)。
同時(shí),得益于玻璃態(tài)處理的物理特性,VIVIT打破了樣本冷凍保存的限制。處理后的組織樣本如琥珀般整體通透、質(zhì)地均勻,不僅能在 - 80°C下長(zhǎng)期保存,還能完全避免冰晶形成帶來(lái)的撕裂與機(jī)械性損傷,真正實(shí)現(xiàn)冷凍切片的結(jié)構(gòu)無(wú)損。
經(jīng)過(guò)VIVIT處理后的樣本無(wú)冰晶損傷
VIVIT能夠?qū)崿F(xiàn)多倍增強(qiáng)熒光,且抑制光淬滅
有了VIVIT這雙“透視眼”,研究者不僅能看清組織內(nèi)部原貌,還能不斷復(fù)用同一樣本并深入探索。VIVIT處理后的組織樣本具有極高的結(jié)構(gòu)穩(wěn)定性和信號(hào)保真性,能承受多輪免疫染色與連續(xù)成像。每一輪染色后,信號(hào)依然清晰,組織結(jié)構(gòu)穩(wěn)定如初。這意味著研究者可在同一組織中依次識(shí)別多個(gè)分子靶點(diǎn),層層疊加,獲得更豐富的空間信息。
與此同時(shí),配合團(tuán)隊(duì)自研的三維重建算法TARRS,VIVIT還支持連續(xù)切片圖像的高精度拼接,可構(gòu)建從單細(xì)胞到全器官的三維圖譜,實(shí)現(xiàn)跨尺度的結(jié)構(gòu)還原。
VIVIT重構(gòu)腦組織三維全景
苑克鑫團(tuán)隊(duì)此次提出的創(chuàng)新性組織透明化方案,不僅打造了能看透組織內(nèi)部結(jié)構(gòu)的“透視眼”,還為其安上了完整的“導(dǎo)航引擎”,貫穿從樣本處理、多模態(tài)染色到三維重建的全流程路徑。
透過(guò)日益清晰的三維空間信息,我們正重新理解生命的結(jié)構(gòu)與秩序。未來(lái),團(tuán)隊(duì)將繼續(xù)推動(dòng)這一技術(shù)與實(shí)際需求深度融合,助力基礎(chǔ)科研、精準(zhǔn)醫(yī)療與智能診斷的發(fā)展。
原標(biāo)題:《擁有“透視眼”!這支清華團(tuán)隊(duì)做到了》
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